日本共同社指出，由于两岸关系紧绷，在台日侨开始为突发状况做准备。为避免自卫队因北京因素无法参与撤侨，日资企业和民间日侨团体以“责任自负”为前提自谋对策。
共同社中文网报导，虽然日本政府称将力求保护侨民，但因日本与台湾没有外交关系，撤侨行动将受限。日本政府派自卫队前往他国撤侨，必须得到对方国家同意，但因为“征求同意的对象是中国大陆而非没有外交关系的台湾等原因”，可能无法使用自卫队的飞机运送侨民。
一家在台日资银行建立全体员工紧急联络网，并按危机应对手册进行避难训练。
日侨团体相关人士表示，若台湾出事，从台湾东部用船撤侨是“现实的选项”，不过截至2021年9月，在台日侨最多约达2万人，要让全部日侨前往东部的难度很高。
日本驻台机构日本台湾交流协会，呼吁在台湾停留3个月以上的日本人前往登记，以便建立联络网，对于撤侨的态度则是“基本上要靠自己努力”。